1型糖尿病的发病机制，包括自身免疫如何被触发目前尚不清楚。由于它有很强的遗传成分，近年来进行了大量的全基因组关联研究(GWAS)，研究人员比较了患有相同疾病或条件的人的整个基因组，寻找可能与该疾病或条件有关的遗传密码的差异。
在最新研究中，加州大学圣地亚哥分校医学院儿科学助理教授KyleGaulton博士和他的同事们将GWAS数据与外周血和胰腺细胞类型的表观基因组图谱相结合。表观基因组图谱详细描述了细胞中基因是如何以及何时开启和关闭的，从而决定了对特定细胞功能至关重要的蛋白质的生产。
该文章发表于年5月19日，来自加州大学圣地亚哥分校的研究人员，在Nature上发表标题为，“Interpretingtype1diabetesriskwithgeneticsandsingle-cellepigenomics”。
在复杂疾病的全基因组关联研究中确定的遗传风险变异主要是非编码变异。将这些风险变异转化为机制见解需要详细的疾病相关细胞类型的基因调控图谱。
本研究结合了两种方法：一种使用,个样本的全基因组1型糖尿病（T1D）关联研究，另一种使用,个细胞核的单细胞核染色质转作酶可及性测序（snATAC–seq）在胰腺和外周血单核细胞中鉴定候选顺式调节元件（cCREs）。
在T细胞和其他细胞类型（包括外分泌胰腺的腺泡和导管细胞）中活跃的cCREs中富集了T1D的风险变异体。多个T1D信号的风险变异与外分泌特异的cCREs重叠，这些cCREs与外分泌特异表达的基因相关。在CFTR位点，T1D风险变异体rs定位于调控CFTR的导管特异性cCRE；风险等位基因降低了导管细胞中的转录因子结合，增强子活性和CFTR表达。
这些发现支持外分泌胰腺在T1D发病机制中的作用，并强调了大规模全基因组关联研究和单细胞表观基因组学在理解复杂疾病的细胞起源方面的能力。
参考文献：
Chiou,J.,Geusz,R.J.,Okino,ML.etal.Interpretingtype1diabetesriskwithgeneticsandsingle-cellepigenomics.Nature().
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